Práctico 9 Medidas repetidas
Para este capitulo necesitas tener instalado el paquete tidyverse, también ayuda tener el paquete broom. Esta clase del curso puede también ser seguida en este link
El ANOVA de medidas repetidas se utiliza cuando queremos ver como un factor afecta nuestra variable respuesta en el tiempo. Ejemplos de esto pueden ser tratamientos de restauración y su efecto en el tiempo. El efecto de una dieta en el cambio de peso en el tiempo, entre otros ejemplos.
El primer ejemplo de este trabajo lo veremos con la base de datos ChickWeight qye viene en R, el cual muestra el experimento de el efecto de una dieta en el crecimiento temprano de 50 pollos (Figura 9.1)
Figura 9.1: Peso de pollos según tiempo y dieta
Para resolver este problema usamos el siguiente
9.0.1 Version 1
MyReapeted <- aov(weight ~ Diet + Error(Chick/Time), data = ChickWeight)
summary(MyReapeted)##
## Error: Chick
## Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
## Diet 3 155863 51954 6.386 0.00104 **
## Residuals 46 374243 8136
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Error: Chick:Time
## Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
## Residuals 50 2306278 46126
##
## Error: Within
## Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
## Residuals 478 78173 163.59.0.2 Version 2
library(lme4)
library(lmerTest)
MyReapeted2 <- lmer(weight ~ Diet + (1|Chick), data = ChickWeight)
anova(MyReapeted2)## Type III Analysis of Variance Table with Satterthwaite's method
## Sum Sq Mean Sq NumDF DenDF F value Pr(>F)
## Diet 91545 30515 3 43.255 6.7413 0.0007857 ***
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 19.1 Tarea 2
El Dr Wario tiene una plantación de plantas pirañas. El le vende plantas a Bowswer y sus hijos, a quienes les interesa tener las plantas mas fuertes y robustas en la menor cantidad de tiempo para poder defender sus castillos de Intrusos. Todo indica que si las plantas llegan mas grandes a su lugar de destino tienen más opciones de crecer y defender a sus dueños. Bowser le da 80,000 monedas de oro a el Dr Wario para que pueda realizar experimentos. El sospecha que alguna combinación de temperatura, riego y humedad son los factores que tienen más relevancia a la hora de cultivar sus plantas pirañas.
Dada la base de datos Explore.csv, diseña el mejor experimento que podría hacer el doctor Wario y determina que condiciones debiera utilizar para cultivar sus plantas.